Cải tiến phương pháp đa hình chiều dài cắt giới hạn đích (Terminal Restriction Fragment Length Polymorphism - t-RFLP) và giải mã trình tự gene rrna 16s sử dụng phân lập các chủng vi khuẩn trên lớp nhày vảy cá

Tóm tắt

Việc đánh bắt cá bất hợp pháp gia tăng nhanh chóng từ các hoạt động đánh bắt không được kiểm soát gây ra mối lo ngại về sự tồn tại các loài cá. Nghiên cứu này hướng đến việc phân lập và định danh các chủng vi khuẩn tương tác với lớp nhày vảy cá và xác định các sự khác biệt của các tiểu phần trong cấu trúc quần thể vi khuẩn tồn tại ở các khu vực khảo sát. Nghiên cứu khuếch đại và tối ưu hóa PCR, biểu hiện kỹ thuật t-RFLP được thực hiện. Cây phát sinh loài nhằm phân tích các mối quan hệ của 19 loài phân lập được với các cơ sở dữ liệu gen được xây dựng. Qua phân tích trình tự, các kết quả cho thấy sự nổi trội của loài Vibrio sp. trong quần thể vi khuẩn trên 4 khu vực khảo sát quanh vùng Illawarra, Úc. Việc sử dụng t-RFLP và RFLP dựa trên PCR được đề xuất cũng như xây dựng các các đoạn mồi nhanh, an toàn, tiết kiệm và đặc hiệu hơn cho việc phát hiện và bảo vệ các loài thủy hải sản sau này