Phân tích in silico gen kháng kháng sinh và sàng lọc ảo chất ức chế gen kháng kháng sinh ở Pseudomonas aeruginosa

##plugins.themes.academic_pro.article.main##

Author

  • Tạ Ngọc Ly
    Trường Đại học Bách khoa - Đại học Đà Nẵng, Đà Nẵng, Việt Nam
    Trần Thị Thu
    Trường Đại học Bách khoa - Đại học Đà Nẵng, Đà Nẵng, Việt Nam

Từ khóa:

AmpC-β-lactamase
blaPAO
kháng kháng sinh
Pseudomonas aeruginosa
sàng lọc ảo

Tóm tắt

Kháng kháng sinh (KKS) là mối đe dọa sức khỏe cộng đồng và ảnh hưởng lớn đến con người. Pseudomonas aeruginosa (PA) là tác nhân gây ra nhiều bệnh nhiễm trùng và tỉ lệ xuất hiện kháng kháng sinh ở vi khuẩn này ngày càng gia tăng. Nghiên cứu này phân tích tần số xuất hiện gen KKS ở PA, từ đó tiến hành sàng lọc chất ức chế gen KKS có tần số xuất hiện cao nhất bằng phương pháp sàng lọc ảo in silico. Phân tích 327 trình tự bộ gen PA cho thấy blaPAO là gen KKS có tần số xuất hiện cao nhất. Sử dụng blaPAO làm mục tiêu, quá trình sàng lọc ảo được thực hiện với 2776 hợp chất có nguồn gốc thiên nhiên. Kết quả sàng lọc được ba hợp chất có tên lần lượt là Apilimod, CHEMBL1542212, TMP-195 là chất ức chế tiềm năng đối với AmpC-β-lactamase. Phân tích dược động học cho thấy 3 hợp chất trên phù hợp với yêu cầu để làm thuốc vì vậy có thể được phát triển thành chất hỗ trợ điều trị KKS sau khi xác nhận bằng các nghiên cứu thực nghiệm.

Tài liệu tham khảo

    [1] Bassetti, A. Vena, A. Russo, A. Croxatto, T. Calandra, and B. Guery, “Rational approach in the management of Pseudomonas aeruginosa infections”, Curr. Opin. Infect. Dis., vol. 31, no. 6, pp. 578–586, 2018.
    [2] Williams et al., “The leading causes of death after burn injury in a single pediatric burn center.”, Crit. Care, vol. 13, no. 6, pp. 1–7, 2009.
    [3] Nathwani, G. Raman, K. Sulham, M. Gavaghan, and V. Menon, “Clinical and economic consequences of hospital-acquired resistant and multidrug-resistant Pseudomonas aeruginosa infections: a systematic review and meta-analysis”, Antimicrob. Resist. Infect. Control, vol. 3, no. 1, pp. 3-32, 2014.
    [4] J. Murray et al., “Global burden of bacterial antimicrobial resistance in 2019: a systematic analysis”, The Lancet, vol. 399, no. 10325 pp. 629–655, 2022.
    [5] Zankari et al., “Identification of acquired antimicrobial resistance genes”, J. Antimicrob. Chemother., vol. 67, no. 11, pp. 2640–2644, 2012.
    [6] N. Ly and N. T. A. Thu, “Identification of Mpro potential of Sars-Cov-2 from the database of Viet nam herb”, TNU J. Sci. Technol., vol. 227, no. 1, pp. 10–18, 2021.
    [7] A. Glen and I. L. Lamont, “β-lactam Resistance in Pseudomonas aeruginosa: Current Status, Future Prospects”, Pathogens, vol. 10, no. 12, 2021.
    [8] Farmer, B. Gautam, S. Singh, P. K. Yadav, and P. A. Jain, “Virtual screening of AmpC/β‐lactamase as target for antimicrobial resistance in Pseudomonas aeruginosa”, Bioinformation, vol. 4, no. 7, pp. 290-294, 2010.
    [9] “Apilimod, C23H26N6O2”, PubChem 2023, [Online] Available:https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/ [Accessed 01/05/2023].
    [10] H. Stahl, C. G. Wermuth, “Apilimod compositions and methods for using”, International Union of Pure and Applied Chemistry, 2015, 374.
    [11] Gayle et al., “Identification of apilimod as a first-in-class PIKfyve kinase inhibitor for treatment of B-cell non-Hodgkin lymphoma”, Blood, vol. 129, no. 13, p. 1768, 2017.
    [12] “N-(2,5-difluorophenyl)-2-[2-[1-(4-methylphenyl)sulfonylpiperidine-3-carbonyl]hydrazinyl]acetamide,C21H24F2N4O4S", PubChem 2023, [Online] Available:https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/, [Accessed 04/05/2023].
Xem thêm

##plugins.themes.academic_pro.article.sidebar##

Đã Xuất bản

Aug 31, 2023
Download
PDF
Cách trích dẫn
Tạ Ngọc Ly, và Trần Thị Thu. “Phân tích in Silico Gen kháng kháng Sinh Và sàng lọc ảo chất ức Chế Gen kháng kháng Sinh ở Pseudomonas Aeruginosa”. Tạp Chí Khoa học Và Công nghệ - Đại học Đà Nẵng, vol 21, số p.h 8.2, Tháng Tám 2023, tr 115-9, https://jst-ud.vn/jst-ud/article/view/8505.

##plugins.themes.academic_pro.article.details##